Вона показує, як вся ДНК клітини миші згорнута всередині клітинного ядра, пише Nature.
Читайте такожКитайські вчені провели унікальний експеримент по редагуванню ДНК
Відомо, що хромосоми і окремі ділянки ДНК взаємодіють один з одним через білки, в результаті чого геном утворює щільні тривимірні структури. Вони не залишаються постійними, і від них, наприклад, залежить, які гени будуть активні в даний момент часу.
Для встановлення просторової організації геному біологи скористалися Hi-C методом. Він полягає в тому, що для фіксації контактуючих ділянок ДНК використовують формальдегід. Потім розрізає ДНК з утворенням фрагментів, що складаються з двох зшитих білками ланцюжків. На наступному етапі ланцюжка в межах фрагмента з'єднуються один з одним кінцями, і встановлюється їх нуклеотидна послідовність.
Вчені проаналізували просторову організацію геному у восьми ембріональних стовбурових клітин миші з одинарним набором хромосом. Виявлено, що ДНК утворює ряд дуже щільних структур. Дослідники побудували 3D-модель геному, в якій демонструється розташування контактуючих енхансерів з промоторами, а також ламін‑асоційованих доменів — ділянок хромосом, що взаємодіють з ядерною мембраною.
Читайте такожГенетики розкрили таємницю "жіночої хромосоми"
Енхансери являють собою ділянки ДНК, які стимулюють активність певних генів. Для цього вони мають контактувати з промотором гена — послідовністю нуклеотидів, що є стартовим майданчиком для процесу транскрипції. Взаємодія відбувається завдяки формуванню петлі ДНК, в результаті чого енхансер виявляється в безпосередній близькості від промотору.
